1. ์๊ฐ ¶
- ์ด๋ฆ : Bioinformatics
- ์ฐธ์ฌ : ์ ํฌ๋ก
- ๊ธฐ๊ฐ : 2002. 3. 14 ~ 2002.8.xx
- ํ๋ก์ ํธ ์์๋๊ธฐ์ ๋ชฉ์ : ๋ณธ ์ฐ๊ตฌ๋ ์ฐจ์ธ๋ Bio๊ธฐ์ ์์ ์ปดํจํฐ ์ ๊ณต์๋ก์ ์ ๊ทผํ ์ ์๋ ๊ธฐ์ ์ธ Bioinformatics์ ๋ํ ๊ธฐ์ด๋ฅผ ๋ฆ๋ ๊ฒ์ ๋ชฉ์ ์ผ๋ก ํ๋ค.
- ํ๋ก์ ํธ ์งํ : ๊ต์ฌ์ ์ ๋ฆฌ์ ๊ด๋ จ ์น์ฌ์ดํธ์ ๋งํฌ, ๊ด๋ จ ๋ฌธ์ ์ ๋ฆฌ๋ฅผ ์ฃผ์ถ์ผ๋ก ํ๊ฒ ์ต๋๋ค. ๋จ์ ๋ฒ์ญ๋ณด๋ค๋ ์๋ฏธ์๋ ์ฌ์ ๋ฆฌ ๊ณผ์ ์ ๋
ธ๋ ฅ์ ๊ธฐ์ธ์ผ ์์ ์
๋๋ค.
- ๊ต์ฌ : โBioinformatics: A practical guide to the analysis of genes and proteinsโ, Second Edition edited by Baxevanis & Ouellette
2.1. NCBI DataModel ¶
์ Model์ ์ด์ฉํ๋๊ฐ? ์ค์ ์ ๊ฐ๊น์ด ๋ชจ๋ธ์ ์ค์ ๋ก ์ผ์ด๋๋ ์ผ์ ๋ณด๋ค ๋ ์ ์ดํด์ํค๊ณ ์์ธก๊ฐ๋ฅํ๊ฒ ํ๋ค.
์ด๋ฐ ์ทจ์ง์์ NCBI๋ sequence-related information์ ๊ดํ ๋ชจ๋ธ์ ๋ง๋ค์๋ค. ๊ทธ๋ฆฌ๊ณ ์ด๋ฐ ๋ชจ๋ธ์ ์ด์ฉํด์ Entrez(data retrieval system)๋ GenBank DB(DNA seq.๋ฅผ ์ ์ฅํด๋ DB, ๋ ๊ฐ์ง๋ ์ ์ ์ ์ฐ๊ตฌ์ ์ค์ํ data๋ค์ด๋ค.)์ ๊ฐ์ด ์ํํธ์จ์ด๋ ํตํฉ DB์์คํ ์ ๊ฐ๋ฅํ๊ฒ ๋ง๋ค์๋ค.
์ด๋ฐ ์ทจ์ง์์ NCBI๋ sequence-related information์ ๊ดํ ๋ชจ๋ธ์ ๋ง๋ค์๋ค. ๊ทธ๋ฆฌ๊ณ ์ด๋ฐ ๋ชจ๋ธ์ ์ด์ฉํด์ Entrez(data retrieval system)๋ GenBank DB(DNA seq.๋ฅผ ์ ์ฅํด๋ DB, ๋ ๊ฐ์ง๋ ์ ์ ์ ์ฐ๊ตฌ์ ์ค์ํ data๋ค์ด๋ค.)์ ๊ฐ์ด ์ํํธ์จ์ด๋ ํตํฉ DB์์คํ ์ ๊ฐ๋ฅํ๊ฒ ๋ง๋ค์๋ค.
=== GenBank flatfile & format VS NCBI data model===
GenBank flatfile์ DNA-centered์ ๋ณด๊ณ ์์ด๋ค. DNA์ค์ฌ์ด๋ผ๋ ๊ฒ์ ์ด๋ค ๋จ๋ฐฑ์ง์ ์ ์ ์ ์ ๋ณด๋ฅผ ์ ์ฅํ๊ณ ์๋ DNA์์ญ์ด DNA์์ coding region์ด๋ผ๊ณ ๋ถ๋ฆฐ๋ค. ๋ฐ๋๋ก ๋๋ถ๋ถ์ Protein seq. DB๋ค์ Protein-centered์ ๊ด์ ์ด๋ฉฐ, ์ด๋ ๋จ๋ฐฑ์ง๊ณผ ์ ์ ์ ์ฌ์ด๋ accesion number(์ ์ ์๋ฅผ ์ ๊ทผํ๊ธฐ์ํ DB์ key๊ฐ) ... ์งํ์ค
GenBank flatfile์ DNA-centered์ ๋ณด๊ณ ์์ด๋ค. DNA์ค์ฌ์ด๋ผ๋ ๊ฒ์ ์ด๋ค ๋จ๋ฐฑ์ง์ ์ ์ ์ ์ ๋ณด๋ฅผ ์ ์ฅํ๊ณ ์๋ DNA์์ญ์ด DNA์์ coding region์ด๋ผ๊ณ ๋ถ๋ฆฐ๋ค. ๋ฐ๋๋ก ๋๋ถ๋ถ์ Protein seq. DB๋ค์ Protein-centered์ ๊ด์ ์ด๋ฉฐ, ์ด๋ ๋จ๋ฐฑ์ง๊ณผ ์ ์ ์ ์ฌ์ด๋ accesion number(์ ์ ์๋ฅผ ์ ๊ทผํ๊ธฐ์ํ DB์ key๊ฐ) ... ์งํ์ค
3.1. NCBI ๋ ¶
National Center for Biotechnology Information ๋ถ์ ์๋ฌผ ์ ๋ณด๋ฅผ ๋ค๋ฃจ๋ ๊ตญ๊ฐ์ ์ธ ์๋ฃ์์ผ๋ก์ ์ค๋ฆฝ๋์์ผ๋ฉฐ, NCBI๋ ๊ณต์ฉ DB๋ฅผ ๋ง๋ค๋ฉฐ, ๊ณ์ฐ์ ๊ดํ ์๋ฌผํ์ ์ฐ๊ตฌ๋ฅผ ์ด๋๊ณ ์์ผ๋ฉฐ, Genome ์๋ฃ๋ฅผ ๋ถ์ํ๊ธฐ ์ํ software ๋๊ตฌ๋ฅผ ๊ฐ๋ฐํ๊ณ , ์๋ฌผํ ์ ๋ณด๋ฅผ ๋ณด๊ธํ๊ณ ์์ต๋๋ค. - ์ฆ, ์ธ๊ฐ์ ๊ฑด๊ฐ๊ณผ ์ง๋ณ์ ์ํฅ์ ๋ฏธ์น๋ ๋ฏธ์ธํ ๊ณผ์ ๋ค์ ๋ณด๋ค ๋ ์ ์ดํดํ๊ธฐ ์ํ ๋ชจ๋ ํ๋์ ์ํ
Established in 1988 as a national resource for molecular biology information, NCBI creates public databases, conducts research in computational biology, develops software tools for analyzing genome data, and disseminates biomedical information - all for the better understanding of molecular processes affecting human health and disease.
3.2. Entrez ๋ ¶
Entrez๋ ํตํฉ ๋ฐ์ดํฐ๋ฒ ์ด์ค retrieval ์์คํ
์ผ๋ก์ DNA, Protein, genome mapping, population set, Protein structure, ๋ฌธํ ๊ฒ์์ด ๊ฐ๋ฅํ๋ค. Entrez์์ Sequence, ํนํ Protein Sequence๋ GenBank protein translation, PIR, PDB, RefSeq๋ฅผ ํฌํจํ ๋ค์ํ DB๋ค์ ์๋ ์์ด์ ๊ฒ์ํ ์ ์๋ค.
...์งํ์ค
...์งํ์ค
4.1. ๋ดํด๋ ์คํฐ๋(nucleotide)๋ ¶
DNA์ RNA๋ฅผ ๊ตฌ์ฑํ๋ nucleotide๋ ์ธ์ฐ๊ธฐ(Phophate), 5 ํ๋น(Sugar)์ธ ๋์ฅ์๋ก๋ณด์ค(deoxyribose), 4 ์ข
๋ฅ์ ์ง์ ์ผ๊ธฐ(Base) ์ค ํ๋๋ฅผ ํฌํจํ์ฌ 3๊ฐ์ ๋ถ์(Phophate, Sugar, Base)๋ก ๊ตฌ์ฑ๋ ๋ฌผ์ง์ด๋ค. ๋น์ ์ธ์ฐ๊ณผ ์ผ๊ธฐ๋ฅผ ์ฐ๊ฒฐ์ํจ๋ค. (์ฉ์ด์ค๋ช
. ์คํฉ : ๋ง์ ๋ถ์๊ฐ ๊ฒฐํฉํ์ฌ ํฐ ๋ถ์๋์ ํํฉ๋ฌผ๋ก ๋๋ ๋ณํ)
์ธ์ฐ๊ธฐ๋ ATP์(๊ทผ์ก์ ์ด ATP๋ฅผ ์๋นํด์ ์๋์ง๋ฅผ ๋ธ๋ค. ์ผ์ข ์ ์๋์ง์.) ์๋ ์ ์๋ ค์ง ์ฐ์ฑ๊ธฐ์ด๋ค. DNA ๋ถ์๋ฅผ ๊ตฌ์ฑํ ๋์๋ ๋น์ ์ง์ ์ฐ๊ฒฐ๋ ํ๋์ ์ธ์ฐ๊ธฐ๋ง ๋จ๋๋ค. 5 ํ๋น ๋์ฅ์๋ก๋ณด์ค(deoxyribose)๋ ATP์ 5 ํ๋น ๋ฆฌ๋ณด์ค(ribose)์ ๋งค์ฐ ์ ์ฌํ๋ค. deoxyribose๋ ribose์ 2๋ฒ ํ์์ ์๋ -OH ๊ธฐ ๋์ -H๊ธฐ๋ฅผ ๊ฐ์ง๊ณ ์๋ค. deoxyribose์ 5๊ฐ ํ์์๋ 1๋ฒ์์ 5๋ฒ๊น์ง ์ซ์๊ฐ ๋ถ์ฌ์ง๋ค.
DNA์ ์กด์ฌํ๋ 4์ข ๋ฅ์ ์ผ๊ธฐ๋ ์๋ฐ๋(adenine), ๊ตฌ์๋(guanine), ํฐ๋ฏผ(thymine), ์ํ ์ (cytosine), ์ฐ๋ผ์ค(uracil)์ด๋ค. ์ด๋ค ์ค์์ ํผ๋ฆฌ๋ฏธ๋(pyrimidine)์ด๋ผ๊ณ ๋ถ๋ฅด๋ thymine, cytosine, uracil์ ์ง์์ ํ์๋ก ๊ตฌ์ฑ๋ 6๊ฐํ์ ๊ณ ๋ฆฌ๋ก ๋์ด ์๋ค. ํจ๋ฆฐ(purine)์ด๋ผ๊ณ ๋ถ๋ฅด๋ adenine, guanine์ ๋ ๋ณต์กํ์ฌ, ์ง์์ ํ์๋ก ๊ตฌ์ฑ๋ 6๊ฐํ๊ณผ 5๊ฐํ์ ์ด์ค ๊ณ ๋ฆฌ๋ก ์ด๋ฃจ์ด์ง๋ค. nucleotide์์ ์ด๋ค ์ผ๊ธฐ๋ค์ deoxyribose์ 1๋ฒ ํ์์ ๊ณต์ ๊ฒฐํฉ์ผ๋ก ์ฐ๊ฒฐ๋์ด ์์ผ๋ฉฐ, ์ธ์ฐ๊ธฐ๋ 5๋ฒ ํ์์ ์ญ์ ๊ณต์ ๊ฒฐํฉ์ผ๋ก ์ฐ๊ฒฐ๋์ด ์๋ค. adenine, guanine, cytosine, thymine, uracil์ ๊ฐ๊ฐ A, G, C, T,U ๋ก ํ๊ธฐ๋๋ค.<๊ทธ๋ฆผ 1>
์ธ์ฐ๊ธฐ๋ ATP์(๊ทผ์ก์ ์ด ATP๋ฅผ ์๋นํด์ ์๋์ง๋ฅผ ๋ธ๋ค. ์ผ์ข ์ ์๋์ง์.) ์๋ ์ ์๋ ค์ง ์ฐ์ฑ๊ธฐ์ด๋ค. DNA ๋ถ์๋ฅผ ๊ตฌ์ฑํ ๋์๋ ๋น์ ์ง์ ์ฐ๊ฒฐ๋ ํ๋์ ์ธ์ฐ๊ธฐ๋ง ๋จ๋๋ค. 5 ํ๋น ๋์ฅ์๋ก๋ณด์ค(deoxyribose)๋ ATP์ 5 ํ๋น ๋ฆฌ๋ณด์ค(ribose)์ ๋งค์ฐ ์ ์ฌํ๋ค. deoxyribose๋ ribose์ 2๋ฒ ํ์์ ์๋ -OH ๊ธฐ ๋์ -H๊ธฐ๋ฅผ ๊ฐ์ง๊ณ ์๋ค. deoxyribose์ 5๊ฐ ํ์์๋ 1๋ฒ์์ 5๋ฒ๊น์ง ์ซ์๊ฐ ๋ถ์ฌ์ง๋ค.
DNA์ ์กด์ฌํ๋ 4์ข ๋ฅ์ ์ผ๊ธฐ๋ ์๋ฐ๋(adenine), ๊ตฌ์๋(guanine), ํฐ๋ฏผ(thymine), ์ํ ์ (cytosine), ์ฐ๋ผ์ค(uracil)์ด๋ค. ์ด๋ค ์ค์์ ํผ๋ฆฌ๋ฏธ๋(pyrimidine)์ด๋ผ๊ณ ๋ถ๋ฅด๋ thymine, cytosine, uracil์ ์ง์์ ํ์๋ก ๊ตฌ์ฑ๋ 6๊ฐํ์ ๊ณ ๋ฆฌ๋ก ๋์ด ์๋ค. ํจ๋ฆฐ(purine)์ด๋ผ๊ณ ๋ถ๋ฅด๋ adenine, guanine์ ๋ ๋ณต์กํ์ฌ, ์ง์์ ํ์๋ก ๊ตฌ์ฑ๋ 6๊ฐํ๊ณผ 5๊ฐํ์ ์ด์ค ๊ณ ๋ฆฌ๋ก ์ด๋ฃจ์ด์ง๋ค. nucleotide์์ ์ด๋ค ์ผ๊ธฐ๋ค์ deoxyribose์ 1๋ฒ ํ์์ ๊ณต์ ๊ฒฐํฉ์ผ๋ก ์ฐ๊ฒฐ๋์ด ์์ผ๋ฉฐ, ์ธ์ฐ๊ธฐ๋ 5๋ฒ ํ์์ ์ญ์ ๊ณต์ ๊ฒฐํฉ์ผ๋ก ์ฐ๊ฒฐ๋์ด ์๋ค. adenine, guanine, cytosine, thymine, uracil์ ๊ฐ๊ฐ A, G, C, T,U ๋ก ํ๊ธฐ๋๋ค.<๊ทธ๋ฆผ 1>
4.2. DNA VS RNA ¶
ํต์ฐ(Nucleic acid)๋ถ์๋ ๋ฏฟ์ ์ ์์ ์ ๋๋ก ๊ธด ์คํฉ์ฒด์ด๋ฉฐ, ๊ฐ ๋ถ์๋ ๊ตฌ์กฐ ๋จ์์ธ nucleotide๋ฅผ ์๋ฐฑ๋ง ๊ฐ์ฉ ํฌํจ ํ๊ณ ์๋ค.
Nucleic acid๋ base์ ์ข ๋ฅ์ 5-carbon sugar์ ์ข ๋ฅ, ๋ถ์ ๊ตฌ์กฐ์ ๋ฐ๋ผ DNA์ RNA๋ก ๋ถ๋ฅ๋๋ค.
Nucleic acid๋ base์ ์ข ๋ฅ์ 5-carbon sugar์ ์ข ๋ฅ, ๋ถ์ ๊ตฌ์กฐ์ ๋ฐ๋ผ DNA์ RNA๋ก ๋ถ๋ฅ๋๋ค.
ํต์ฐ | ์ผ๊ธฐ์ ์ข ๋ฅ | 5ํด๋น์ ์ข ๋ฅ | ๋ถ์ ๊ตฌ์กฐ |
DNA | A, G, C, T | Dioxyribose | 2์ค ๋์ |
RNA | A, G, C, U | Ribose | ๋จ์ผ ์ฌ์ฌ |
4.3. DNA ¶
์ด ๊ทธ๋ฆผ์ DNA์ ๋ชจ์๋์ด๋ค.
DNA๋ a twisted ladder๋ผ๊ณ ํํ๋๋๋ฐ ์ฌ๋ค๋ฆฌ์ ๊ฐ๊ฐ์ strand๋ ๋น๊ณผ ์ธ์ฐ์ ๊ฒฐํฉ์ ์๋ฏธํ๊ณ , lung์ Base๋ค์ ๊ฒฐํฉ์ ์๋ฏธํ๋ค. Base๋ค์ ์ฌ์ด์ ๊ฒฐํฉ์ ์์๊ฒฐํฉ์ ์ด๋ฃจ๋๋ฐ, A์ T, C์ G๊ฐ ๊ฒฐํฉ์ด ์ด๋ฃจ์ด์ง๋ค. ๋ฐ๋ผ์ DNA๋ฅผ ๋ถ์ํด base๋ค์ ์๋ฅผ ๋น๊ตํด๋ณด๋ฉด A์ T์ ์๊ฐ ๊ฐ๊ณ , C์ G์ ์๊ฐ ๊ฐ์์ ์ ์ ์๋ค. ์ด์ ํ์ชฝ ๊ฐ๋ฅ์ ์๋ nucleotide๋ ๋ค๋ฅธ์ชฝ ๊ฐ๋ฅ์ nucleotide ์์ด์ ๊ฒฐ์ ํ๊ฒ ๋๋ค. ๊ทธ๋์ ๊ทธ ๋ ๊ฐ๋ฅ์ ์๋ณด์ (complementary) ์ด๋ผ๊ณ ํ๋ค. ์ฆ, DNA ๋ถ์๋ฅผ ์์ง์ผ๋ก ๊ทธ๋ฆฌ๋ฉด ํ ๊ฐ๋ฅ์ 5'์์ 3'์ผ๋ก ์์์ ์๋๋ก ๋ฌ๋ฆฌ๊ณ , ๋ค๋ฅธ ๊ฐ๋ฅ์ 5'์์ 3'์ผ๋ก ์๋๋ก ์๋ก ๋ฌ๋ฆฐ๋ค.(5', 3' ํจ์๋ผ๊ณ ์๊ณ ์์, ์ ํํ ๋ชจ๋ฆ)
DNA๋ a twisted ladder๋ผ๊ณ ํํ๋๋๋ฐ ์ฌ๋ค๋ฆฌ์ ๊ฐ๊ฐ์ strand๋ ๋น๊ณผ ์ธ์ฐ์ ๊ฒฐํฉ์ ์๋ฏธํ๊ณ , lung์ Base๋ค์ ๊ฒฐํฉ์ ์๋ฏธํ๋ค. Base๋ค์ ์ฌ์ด์ ๊ฒฐํฉ์ ์์๊ฒฐํฉ์ ์ด๋ฃจ๋๋ฐ, A์ T, C์ G๊ฐ ๊ฒฐํฉ์ด ์ด๋ฃจ์ด์ง๋ค. ๋ฐ๋ผ์ DNA๋ฅผ ๋ถ์ํด base๋ค์ ์๋ฅผ ๋น๊ตํด๋ณด๋ฉด A์ T์ ์๊ฐ ๊ฐ๊ณ , C์ G์ ์๊ฐ ๊ฐ์์ ์ ์ ์๋ค. ์ด์ ํ์ชฝ ๊ฐ๋ฅ์ ์๋ nucleotide๋ ๋ค๋ฅธ์ชฝ ๊ฐ๋ฅ์ nucleotide ์์ด์ ๊ฒฐ์ ํ๊ฒ ๋๋ค. ๊ทธ๋์ ๊ทธ ๋ ๊ฐ๋ฅ์ ์๋ณด์ (complementary) ์ด๋ผ๊ณ ํ๋ค. ์ฆ, DNA ๋ถ์๋ฅผ ์์ง์ผ๋ก ๊ทธ๋ฆฌ๋ฉด ํ ๊ฐ๋ฅ์ 5'์์ 3'์ผ๋ก ์์์ ์๋๋ก ๋ฌ๋ฆฌ๊ณ , ๋ค๋ฅธ ๊ฐ๋ฅ์ 5'์์ 3'์ผ๋ก ์๋๋ก ์๋ก ๋ฌ๋ฆฐ๋ค.(5', 3' ํจ์๋ผ๊ณ ์๊ณ ์์, ์ ํํ ๋ชจ๋ฆ)
4.4. DNA Republication ¶
์์จ๊ณผ ํฌ๋ฆญ์ DNA์ ๊ตฌ์กฐ, ํนํ ์์ ์ด๋ฃฌ nucleotide์ ์๋ณด์ฑ์ด ์ ์ ๋ฌผ์ง์ ์ ํํ ๋ณต์ ๊ธฐ์์ ํต์ฌ์์ ์์๋ค. ๊ทธ๋ค์ "์ฐ๋ฆฌ๊ฐ ๊ฐ์ ํ ์ผ๊ธฐ์ ํ์ฑ์๋ฆฌ๊ฐ ์ ์ ๋ฌผ์ง์ ๋ณต๊ธฐ์์ ์ ์ํ๊ณ ์์์ ๋๋ ์ ์ด์๋ค."๋ผ๊ณ ๋งํ์๋ค. ๊ทธ๋ค์ ์ด์ค ๋์ ์ ๋ ๊ฐ๋ฅ์ด ๋ถ๋ฆฌ๋๊ณ ๊ทธ ๊ฐ๊ฐ์ ๊ฐ๋ฅ์ ์ฃผํ (template)์ผ๋ก ํ์ฌ ์๋ก์ด ์๋ณด์ ์ฌ์ฌ์ด ํ์ฑ๋๋ค๋ ๋จ์ํ ๋ณต์ ๋ชจ๋ธ์ ๋ง๋ค์๋ค.
4.5. DNA์ ์ผ์์ฒด๋ด์์์ ํธ์ฑ(Organization) ¶
์ธ๊ฐ์ ์ผ์์ฒด(chromosome)์ ์ข
๋ฅ๋ 23๊ฐ์ด๋ค. 22๊ฐ๋ ์์ผ์์ฒด(autosome)์ด๊ณ 1๊ฐ๋ ์ฑ์ผ์์ฒด(sex chromosome)์ด๋ค. ํ ์ข
๋ฅ์ ์ผ์์ฒด๋ ์๋ก์ ์์ ๊ฐ์ง๊ณ ์๋ค. ๋ฐ๋ผ์ ์ธ๊ฐ์ ์ผ์์ฒด๊ตฐ(genome)์ 46๊ฐ์ chromosome์ผ๋ก ๊ตฌ์ฑ๋์ด ์๋ค. chromosome์ ์ธํฌ๋ด์์ ๋๋ถ๋ถ์ ์๊ฐ์ ์คํ๋(fiber)๊ฐ์ ํํ๋ก ์๋๋ฐ.. ์ด๋ chromosome ๊ธฐ๋ณธ๋จ์์ธ ๋ดํด๋ ์ค์(Nucleosome)๋ค์ด ๊ฒฐํฉ๋ ํํ์ด๋ค. ์ด nucleosome์ ํ๋์ ํ์คํค(histone)๋จ๋ฐฑ์ง์ DNA๊ฐ ๋๋ฒ ํ๊ฐ์ ํํ์ด๋ค. --์์ฑ์ค
4.6. Gene๋ ¶
์ ์ ํ์ง์ ๋งํ๋ฉฐ ์ ์ ์ ๊ด์ฌํ๋ ํน์ ๋ฌผ์ง์ด๋ค. Gene์ ๋ชจ์์ด Genome์ด๋ค. ๋ํ ์ด Gene๋ DNA์ ๊ทธ ๋ด์ฉ์ด ์ํธํ ๋์ด ์๋ค. ์ด๋ฏธ ์๊ณ ์์์ง๋ ๋ชจ๋ฅด๊ฒ ์ง๋ง, Gene์ด๋ผ๋ ๊ฒ์ DNA์ ์ผ๊ธฐ ๋ฐฐ์ด์ด๋ค. ์ด ์ผ๊ธฐ ๋ฐฐ์ด(base sequence)์ด ์ด๋ค ๊ณผ์ ์ ํตํด์ ๋์๋๋ ์์๋ก ์๋ฏธ๋
ธ์ฐ(amino acid)๋ผ๋ฆฌ์ peptide๊ฒฐํฉ์ ํ์ฌ ๋จ๋ฐฑ์ง๋ก ๋ํ๋ ๊ฒ์ ์ ์ ํ์ง ๋ฐํ์ด๋ผ๊ณ ํ๋ค.
์ฐ์ ์๋ฌผํ์ ํต์ฌ ์ด๋ก ์ด Central Dogma(์ค์ฌ์ด๋ก )์ ๋ํด ์์๋ณด๊ฒ ๋ค.
์ด ์ด๋ก ์ DNA๊ฐ ์ด๋ป๊ฒ ๋จ๋ฐฑ์ง์ ์์ฑํ๋ ๊ฐ๋ฅผ ๋ณด์ฌ์ฃผ๊ณ ์๋ค.
๊ทธ๋ฆผ. 1
๊ทธ๋ฆผ 1์ ์ฐธ์กฐํ๋ฉด DNA๋ 2์ค ๋์ ํ ๊ตฌ์กฐ๋ก ๋์ด์๋ค. ์ด๊ฒ์ด ์ธํฌ ๋ถ์ด ๊ณผ์ ์์ DNA์ ์ ์ ์ํธ๋ฅผ ๋ณต์ฌํ mRNA๋ก ๋ฐ๋๋ฉฐ ์ด mRNA๊ฐ Ribosome์ ๋ค์ด๊ฐ๋ฉด tRNA๋ mRNA์ ๋ด๊ฒจ์๋ DNA์ ์ ์ํธ๋ฅผ ๋ถ์ํ์ฌ์ ๋์๋๋ amino acid๋ฅผ ๊ฐ์ ธ์จ๋ค. ์ด๋ฐ ๊ณผ์ ์ด ๋ฐ๋ณต๋๊ณ , amino acid์ฌ์ด์๋ peptide๊ฒฐํฉ์ ์ด๋ฃจ๋ฉด์ ์ด๋ ๋จ๋ฐฑ์ง๋ก ํ์ง ๋ฐํ์ด ๋๋ค. -- ์งํ์ค..
์ฐ์ ์๋ฌผํ์ ํต์ฌ ์ด๋ก ์ด Central Dogma(์ค์ฌ์ด๋ก )์ ๋ํด ์์๋ณด๊ฒ ๋ค.
์ด ์ด๋ก ์ DNA๊ฐ ์ด๋ป๊ฒ ๋จ๋ฐฑ์ง์ ์์ฑํ๋ ๊ฐ๋ฅผ ๋ณด์ฌ์ฃผ๊ณ ์๋ค.
๊ทธ๋ฆผ. 1
๊ทธ๋ฆผ 1์ ์ฐธ์กฐํ๋ฉด DNA๋ 2์ค ๋์ ํ ๊ตฌ์กฐ๋ก ๋์ด์๋ค. ์ด๊ฒ์ด ์ธํฌ ๋ถ์ด ๊ณผ์ ์์ DNA์ ์ ์ ์ํธ๋ฅผ ๋ณต์ฌํ mRNA๋ก ๋ฐ๋๋ฉฐ ์ด mRNA๊ฐ Ribosome์ ๋ค์ด๊ฐ๋ฉด tRNA๋ mRNA์ ๋ด๊ฒจ์๋ DNA์ ์ ์ํธ๋ฅผ ๋ถ์ํ์ฌ์ ๋์๋๋ amino acid๋ฅผ ๊ฐ์ ธ์จ๋ค. ์ด๋ฐ ๊ณผ์ ์ด ๋ฐ๋ณต๋๊ณ , amino acid์ฌ์ด์๋ peptide๊ฒฐํฉ์ ์ด๋ฃจ๋ฉด์ ์ด๋ ๋จ๋ฐฑ์ง๋ก ํ์ง ๋ฐํ์ด ๋๋ค. -- ์งํ์ค..
Bioinformatics๋ฅผ ๊ณต๋ถํ๋ ค๋ ์ฌ๋๋ค์ ์ํด
์ ๋ ์ปดํจํฐ ์ง์๋ง์ผ๋ก ์น๋ถ๊ฑธ๋ ค๊ณ ํ์ง ๋ง์์ผ ํ ๊ฒ ์
๋๋ค. ์ปดํจํฐ ์ง์๋ง์ผ๋ก๋ ์ ๋ง ๊ธฐ์ ์ ์์ค ๋ฐ์ ๋์ง ๋ชปํฉ๋๋ค. ๊ทธ์ชฝ ์ง์์ด ํ์ํ๋ค๊ณ ํด๋ ์ด๊ฑด ๊ธฐ์ ์ ์ง์์ด๋ผ๊ธฐ๋ณด๋ค๋ ๊ณผํ, ์ฆ, ์ ์ฐํ(Computer Science)์ ์ง์์ด ํ์ํฉ๋๋ค. ๊ทธ๋ฆฌ๊ณ Bioinformatics๋ฅผ ์ ๋๋ก ๊ณต๋ถํ๋ ค๋ฉด ์ปดํจํฐ ๋ถ์ผ๋ฅผ ๋นผ๊ณ ๋ ์ต์ํ ์๋ฌผํ ๊ฐ๋ก , ๋ถ์ ์๋ฌผํ, ์ํํ, ์ ์ ํ, ํต๊ณํ ๊ฐ๋ก , ํ๋ฅ ๋ก , ๋ค๋ณ๋ ํต๊ณํ, ๋ฏธ์ ๋ถ์ ์์์ผ ํฉ๋๋ค. ์ด๋ฐ ๊ฒ์ ๋ชจ๋ฅด๊ณ ๋ฐ์ด๋ค๊ฒ ๋๋ฉด ๊ฐ์ฅ์๋ฆฌ๋ง ๋งด๋๊ฒ ๋ฉ๋๋ค. ๊ตญ๋ด์์ Bioinformatics๋ฅผ ํ๋ ค๋ ๋๋ถ๋ถ์ ์ ์ฐํ๊ณผ ๊ต์๋๋ค์ด ์ด ๋ถ๋ฅ์ ์ํ๋ค๋ ์ ์ด ์๊ธํ ์ฌ์ค์ด์ฃ .
์ ๋๋ก ๋ ์๋ด๋ฅผ ๋ฐ์ผ๋ ค๋ฉด, ์์ธ์ฐ ๋ฐ์ฌ๋์ ์ฌ์ดํธ๋ฅผ ์ถ์ฒํฉ๋๋ค. http://www.bioinformatics.pe.kr/ -- ๊น์ฐฝ์ค
DeleteMe QnA๋ฅผ ์ฝ์ด ๋ณด์๋๋ฐ ์์ ๊ฐ์ด '๋' ๋จ์ด์ง๋๊ตฐ์.(์ด๊ฒ๋ง์ด ์๋์ด๋ ์ค๋ ๊ต์ฌ๋ฅผ ๋ณด๋๋ฐ ์ฒ์๋ณด๋ ์์ํ ๋จ์ด๋ค ๋๋ฌธ์ ์ฌ์ ์ฐพ์ผ๋ด, ์ฌ์ดํธ ๋์๋ค๋๋ฉฐ ์ด๋ค ๊ฑด์ง ์์๋ณด๋ด, ํด๋งธ๋๋ฐ..) ๊ทธ๋๋, ์ด๋ฆ์ ์ธ๋ฒ์ด๋ ํ๋ฆฐ ์ด ํ๋ฌธ์ด ๋ญ์ง๋ ์๊ณ ์ถ๊ณ ,:) ๋ค์์ ํน์ ์ ์ ๋น์ทํ ์ง์๋ง ๊ฐ์ง ์ฌ๋์ด ์ด์ชฝ์ ๊ด์ฌ์ ๊ฐ์ง๊ณ ์ฐ๊ตฌ๋ฅผ ํ ๋ ๋์์ด ๋ ์ ์์์ผ๋ฉด ํฉ๋๋ค.
DeleteMe ์ด์ ํ๋ก์ ํธ๋ผ ํ ์ ๋์ ์ฑ๊ณผ๋ฅผ ๋ง๋ค์ด์ผ๊ฒ ๊ตฐ์.